94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0202 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  71 
 
 		 570 aa  868    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  69.31 
 
 		 568 aa  843    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 569 aa  1185    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  68.13 
 
 		 570 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  61.62 
 
 		 570 aa  733    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  68.71 
 
 		 578 aa  850    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  66.61 
 
 		 568 aa  816    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  69.31 
 
 		 566 aa  848    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  68.01 
 
 		 571 aa  831    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  50.98 
 
 		 567 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  50.72 
 
 		 567 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.16 
 
 		 567 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  51.62 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  47.26 
 
 		 566 aa  531  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  46.25 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  43.45 
 
 		 583 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.14 
 
 		 583 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  45.04 
 
 		 582 aa  498  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.22 
 
 		 584 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.28 
 
 		 583 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  42.91 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  41.78 
 
 		 597 aa  485  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.07 
 
 		 584 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  43.69 
 
 		 565 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.31 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.02 
 
 		 566 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.13 
 
 		 558 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  35.71 
 
 		 555 aa  342  9e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.79 
 
 		 552 aa  337  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.12 
 
 		 556 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.37 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.6 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.13 
 
 		 562 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.12 
 
 		 566 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  37.71 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.25 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  33.85 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.22 
 
 		 548 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.81 
 
 		 548 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.39 
 
 		 543 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.34 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.04 
 
 		 548 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.21 
 
 		 543 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.94 
 
 		 426 aa  53.5  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  48.44 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.23 
 
 		 432 aa  51.2  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  42.65 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.29 
 
 		 433 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  42.67 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  43.75 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  41.54 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  44.12 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.3 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 429 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.86 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  41.79 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  41.43 
 
 		 475 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 425 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 579 aa  47.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  46.88 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  46.88 
 
 		 470 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  37.66 
 
 		 416 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  42.19 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  45.45 
 
 		 426 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  44.62 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.69 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  41.56 
 
 		 590 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  46.15 
 
 		 422 aa  47  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  42.47 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  37.76 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  32.99 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  41.54 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  39.06 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  41.56 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  29.63 
 
 		 370 aa  45.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  35 
 
 		 485 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  35 
 
 		 485 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  45.45 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  43.24 
 
 		 574 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  34.09 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  41.79 
 
 		 446 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  42.42 
 
 		 431 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 588 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  46.27 
 
 		 441 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  40.91 
 
 		 528 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.59 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  35 
 
 		 485 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  37.31 
 
 		 420 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.3 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>