123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1188 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  67.62 
 
 		 565 aa  802    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  69.38 
 
 		 566 aa  843    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  100 
 
 		 566 aa  1183    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  52.35 
 
 		 566 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  46.88 
 
 		 571 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  46.77 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.65 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  44.04 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  44.31 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.25 
 
 		 569 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  45.04 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  43.08 
 
 		 583 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.9 
 
 		 567 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  45.7 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.73 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.72 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.56 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  44.8 
 
 		 567 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  43.06 
 
 		 583 aa  485  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.66 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  42.27 
 
 		 582 aa  478  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.65 
 
 		 584 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.27 
 
 		 584 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  41.65 
 
 		 597 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  38.16 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.23 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.52 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.04 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.8 
 
 		 552 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.59 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.02 
 
 		 562 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.83 
 
 		 561 aa  359  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.59 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.43 
 
 		 566 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  38.46 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  33.56 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.17 
 
 		 542 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.6 
 
 		 548 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.02 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.6 
 
 		 548 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.02 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.22 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.59 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  40.66 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  51.56 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.18 
 
 		 432 aa  54.3  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  36.46 
 
 		 461 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  56.1 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  42.86 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  42.19 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  57.14 
 
 		 475 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  42.86 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  41.27 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  35.29 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  39.47 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.58 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  43.75 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  40.62 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  38.1 
 
 		 457 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  43.75 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  39.06 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  40.98 
 
 		 560 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  36.71 
 
 		 479 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  41.94 
 
 		 453 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  41.94 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  41.94 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  41.94 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  41.94 
 
 		 453 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  41.94 
 
 		 453 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  31.4 
 
 		 474 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  41.94 
 
 		 470 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.91 
 
 		 411 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  38.1 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  40.32 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  38.67 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  39.71 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  37.33 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  39.47 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  33.85 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  29.55 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  39.39 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  41.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  42.42 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  39.13 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.27 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  40.98 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  39.13 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  40.3 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  31.63 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  39.06 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  38.71 
 
 		 577 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  35.92 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  38.1 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.82 
 
 		 447 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  43.33 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>