81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2401 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 542 aa  1114    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  54.61 
 
 		 572 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.74 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.74 
 
 		 548 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.01 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  49.54 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.62 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  48.96 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  49.54 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  47.37 
 
 		 558 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.99 
 
 		 543 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.82 
 
 		 562 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  47.9 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.6 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  48.02 
 
 		 549 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.94 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.16 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.22 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.17 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  37.3 
 
 		 566 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  36.07 
 
 		 566 aa  319  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  36.99 
 
 		 582 aa  318  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  36.3 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.25 
 
 		 569 aa  317  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.57 
 
 		 570 aa  316  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  34.52 
 
 		 568 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.22 
 
 		 567 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.8 
 
 		 578 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  35.97 
 
 		 567 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.22 
 
 		 567 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  33.56 
 
 		 583 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  36.8 
 
 		 567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  35.78 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.64 
 
 		 583 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  34.35 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  35.73 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.12 
 
 		 583 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  34.17 
 
 		 566 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.88 
 
 		 570 aa  293  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.83 
 
 		 584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.03 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.78 
 
 		 584 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  33.73 
 
 		 597 aa  266  7e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  44.44 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  34.29 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.06 
 
 		 428 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 		 425 aa  50.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.06 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  45.9 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  42.62 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.5 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  43.75 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  45.31 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  36.59 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  40.3 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.77 
 
 		 511 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.75 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  34.29 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  40.32 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  44.26 
 
 		 424 aa  47  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  49.18 
 
 		 386 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  42.86 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  44.44 
 
 		 420 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  41.67 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  47.62 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  41.67 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  44.44 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  32.04 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.5 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  47.54 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  35.94 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  34.38 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  43.86 
 
 		 435 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 434 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  39.34 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  41.79 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 		 430 aa  43.5  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>