66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2462 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  61.72 
 
 		 555 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  58.23 
 
 		 556 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  70.94 
 
 		 561 aa  820    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  84.93 
 
 		 566 aa  996    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  70.64 
 
 		 562 aa  831    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  60.4 
 
 		 558 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  66.78 
 
 		 561 aa  785    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 566 aa  1165    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  68.62 
 
 		 561 aa  806    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  53.49 
 
 		 549 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  47.74 
 
 		 572 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.94 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.26 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.07 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.25 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.88 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.2 
 
 		 548 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.51 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.83 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  39.2 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.89 
 
 		 567 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.89 
 
 		 567 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  38.89 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  39.07 
 
 		 567 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  36.45 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.4 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  38.04 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.44 
 
 		 570 aa  371  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  35.4 
 
 		 583 aa  369  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.88 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  39.18 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  38.21 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  37.54 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.48 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.62 
 
 		 584 aa  352  7e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.66 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.6 
 
 		 566 aa  352  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  33.62 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  38.58 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  33.9 
 
 		 597 aa  346  7e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  37.15 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.02 
 
 		 569 aa  343  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.85 
 
 		 566 aa  342  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  39.74 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  44.26 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  40.91 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  42.25 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.94 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 586 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  43.66 
 
 		 572 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  40.51 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  39.68 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  40.28 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  39.68 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  39.68 
 
 		 425 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.58 
 
 		 424 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  38.36 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  33.9 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  38.96 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.74 
 
 		 422 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  43.28 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  32.85 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  38.36 
 
 		 413 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>