91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5775 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  89.69 
 
 		 543 aa  965    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.76 
 
 		 548 aa  806    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.39 
 
 		 548 aa  801    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 543 aa  1077    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  73.13 
 
 		 548 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  72.94 
 
 		 548 aa  807    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  49.54 
 
 		 542 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  47.21 
 
 		 572 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.51 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.68 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.13 
 
 		 561 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  44.24 
 
 		 555 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.7 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.06 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.46 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.51 
 
 		 566 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  43.91 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.82 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.81 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.95 
 
 		 567 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  34.41 
 
 		 567 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.41 
 
 		 567 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  35.89 
 
 		 566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  34.95 
 
 		 566 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  35.36 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  36.2 
 
 		 567 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.88 
 
 		 570 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  34.17 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 568 aa  290  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.74 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.21 
 
 		 569 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 583 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.58 
 
 		 583 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.88 
 
 		 570 aa  282  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  33.96 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 568 aa  273  9e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  32.44 
 
 		 565 aa  264  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  33.22 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.54 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.78 
 
 		 584 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.52 
 
 		 566 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 597 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  39.33 
 
 		 446 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  36.47 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  35.96 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  39.33 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  50.88 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  50.82 
 
 		 484 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  36.78 
 
 		 424 aa  50.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  49.12 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  43.08 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  49.12 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  49.18 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  50.82 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  50.82 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  45.9 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  42.86 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.5 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.86 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  45.9 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  35.96 
 
 		 424 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.67 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  38.71 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  49.18 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  35.56 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  49.18 
 
 		 484 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.33 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  35.56 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.94 
 
 		 436 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.16 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  43.86 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  29.65 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  42.19 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  47.54 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.38 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.29 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  40.32 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.55 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.19 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  45.33 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  37.29 
 
 		 422 aa  43.9  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.03 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  36.67 
 
 		 427 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  42.86 
 
 		 395 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.32 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.75 
 
 		 432 aa  43.5  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  34.38 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  34.83 
 
 		 439 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>