51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2859 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  100 
 
 
555 aa  1150    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  73.01 
 
 
556 aa  853    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  63.38 
 
 
561 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  73.36 
 
 
558 aa  862    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  61.72 
 
 
566 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  60.15 
 
 
566 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  61.85 
 
 
562 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  58.24 
 
 
561 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  63.38 
 
 
561 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  58.65 
 
 
549 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  52.44 
 
 
572 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.96 
 
 
542 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.86 
 
 
552 aa  435  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.61 
 
 
548 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.61 
 
 
548 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.6 
 
 
548 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.42 
 
 
548 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.24 
 
 
543 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  39.71 
 
 
566 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.58 
 
 
567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.12 
 
 
543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  37.65 
 
 
583 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.65 
 
 
583 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.61 
 
 
583 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  39.67 
 
 
567 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.86 
 
 
567 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  40.4 
 
 
567 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  38.69 
 
 
582 aa  385  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  37.26 
 
 
583 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  38.16 
 
 
566 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  38.34 
 
 
566 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.78 
 
 
570 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.73 
 
 
570 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.28 
 
 
584 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  37.18 
 
 
565 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.57 
 
 
584 aa  365  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  37.39 
 
 
568 aa  362  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  36.64 
 
 
568 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  37.28 
 
 
578 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  34.19 
 
 
597 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  37.74 
 
 
571 aa  349  9e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.66 
 
 
566 aa  347  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.71 
 
 
569 aa  342  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  36.02 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1734  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.64 
 
 
422 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.409452  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  50 
 
 
479 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  40.98 
 
 
427 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 
434 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  40.98 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.57 
 
 
427 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>