62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2109 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  100 
 
 
565 aa  1177    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  67.62 
 
 
566 aa  802    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  62.34 
 
 
566 aa  726    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  47.86 
 
 
566 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  45.6 
 
 
571 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  45.55 
 
 
568 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.58 
 
 
567 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  44.05 
 
 
566 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  43.86 
 
 
570 aa  478  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  43.64 
 
 
567 aa  472  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  45.62 
 
 
570 aa  473  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  42.4 
 
 
567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.23 
 
 
567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  43.69 
 
 
568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.73 
 
 
570 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.69 
 
 
569 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  40.14 
 
 
583 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  39.62 
 
 
583 aa  463  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.14 
 
 
583 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.48 
 
 
583 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.91 
 
 
584 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.66 
 
 
584 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  39.9 
 
 
597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  41.3 
 
 
582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.67 
 
 
578 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.52 
 
 
556 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.18 
 
 
555 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.18 
 
 
566 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 
561 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.54 
 
 
561 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.12 
 
 
558 aa  360  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.33 
 
 
562 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.25 
 
 
561 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.81 
 
 
552 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.68 
 
 
566 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  35.61 
 
 
549 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  32.31 
 
 
572 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.78 
 
 
542 aa  293  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.91 
 
 
548 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.09 
 
 
548 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.09 
 
 
548 aa  277  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.94 
 
 
548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.73 
 
 
543 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.44 
 
 
543 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  39.51 
 
 
474 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  46.88 
 
 
425 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.03 
 
 
425 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  45.31 
 
 
424 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  37.36 
 
 
412 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  42.86 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  40.62 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.58 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  40.62 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 
432 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  28.93 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  39.68 
 
 
475 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  34.48 
 
 
395 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  48.78 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  36.25 
 
 
499 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.32 
 
 
431 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  34.62 
 
 
457 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  38.96 
 
 
534 aa  43.9  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>