107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1472 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  66.61 
 
 		 566 aa  806    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  67.19 
 
 		 571 aa  806    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  62.87 
 
 		 570 aa  736    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  66.73 
 
 		 570 aa  796    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  67.25 
 
 		 568 aa  808    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  67.31 
 
 		 568 aa  805    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  100 
 
 		 578 aa  1199    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  68.71 
 
 		 569 aa  850    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  65.91 
 
 		 570 aa  803    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  51.65 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  51.4 
 
 		 567 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.47 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  51.57 
 
 		 567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  44.58 
 
 		 583 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.33 
 
 		 583 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.41 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 566 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  44.22 
 
 		 583 aa  497  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  41.67 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.79 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.17 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  43.25 
 
 		 582 aa  479  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  41.26 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  41.67 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.87 
 
 		 566 aa  445  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.21 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.28 
 
 		 555 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.58 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.23 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.57 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.2 
 
 		 561 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.8 
 
 		 562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.27 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.43 
 
 		 552 aa  336  7.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.41 
 
 		 561 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  39.75 
 
 		 549 aa  332  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  34.15 
 
 		 572 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.8 
 
 		 542 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.34 
 
 		 548 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.36 
 
 		 543 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.71 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.89 
 
 		 548 aa  292  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.71 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.2 
 
 		 548 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  41.43 
 
 		 424 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  47.54 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  45.31 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  40.62 
 
 		 427 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  43.82 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  42.86 
 
 		 395 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  45.31 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  43.94 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  41.54 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  42.42 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  36.96 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  42.86 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  28.4 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  28.4 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  28.4 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  41.27 
 
 		 475 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.92 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  40.21 
 
 		 578 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  34.65 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.3 
 
 		 426 aa  47.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  46.88 
 
 		 426 aa  47  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.39 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  48.44 
 
 		 583 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  36.36 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  44.62 
 
 		 417 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  39.39 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  36.71 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.57 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.62 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01380  dihydropyrimidinase, putative  39.33 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.39 
 
 		 431 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 560 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  42.62 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  30.95 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  30.85 
 
 		 466 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  44.64 
 
 		 590 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  36.11 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  40.58 
 
 		 589 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  41.27 
 
 		 425 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  37.31 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.94 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  43.08 
 
 		 581 aa  44.3  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.3 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 433 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  36.9 
 
 		 563 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.69 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  36.9 
 
 		 563 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  30.16 
 
 		 485 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>