85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1795 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  57.56 
 
 		 558 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  100 
 
 		 549 aa  1129    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  58.65 
 
 		 555 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  59.29 
 
 		 556 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  55.29 
 
 		 561 aa  611  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  55.1 
 
 		 561 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  55.87 
 
 		 562 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  54.04 
 
 		 566 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  55.13 
 
 		 566 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  55.73 
 
 		 561 aa  598  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  49.73 
 
 		 572 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.03 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.77 
 
 		 548 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  44.24 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.68 
 
 		 548 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.41 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.59 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.06 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.91 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  39.64 
 
 		 566 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.99 
 
 		 566 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.25 
 
 		 567 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.07 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  37.06 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  38.71 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.33 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.33 
 
 		 583 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  41.27 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.57 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.39 
 
 		 584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  38.15 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.51 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.32 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  35.61 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  37.61 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.66 
 
 		 570 aa  346  7e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  33.17 
 
 		 597 aa  339  7e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  36.3 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  36.38 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  35.61 
 
 		 571 aa  334  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.97 
 
 		 569 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  34.57 
 
 		 570 aa  326  6e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  35.97 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  50 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  28.3 
 
 		 431 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  46.38 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  44.05 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  38.3 
 
 		 507 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  42.11 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 432 aa  50.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40 
 
 		 427 aa  50.4  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  42.22 
 
 		 412 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.78 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  43.75 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  44.62 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  43.08 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  40.21 
 
 		 431 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  44.62 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  41.54 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  44.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  38.16 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  40.58 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  40.62 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  50 
 
 		 489 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  50 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.28 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  28.3 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  38.16 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.3 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  34.91 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.54 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  36.49 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  42.42 
 
 		 572 aa  44.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.75 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.36 
 
 		 533 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  36.51 
 
 		 424 aa  44.3  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  39.66 
 
 		 481 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  40.32 
 
 		 351 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  43.55 
 
 		 429 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.31 
 
 		 428 aa  43.5  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>