More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1479 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  100 
 
 
436 aa  842    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.53 
 
 
447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.22 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 
424 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.26 
 
 
422 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  39.86 
 
 
426 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.13 
 
 
425 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.21 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  40.86 
 
 
423 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.47 
 
 
425 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 
430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.86 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 
424 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.96 
 
 
436 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.45 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.22 
 
 
425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.42 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  42.08 
 
 
431 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.81 
 
 
429 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.57 
 
 
429 aa  296  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.35 
 
 
427 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.1 
 
 
431 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.43 
 
 
433 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.63 
 
 
428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.92 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.02 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.37 
 
 
433 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  38.26 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  40.64 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.9 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  39.52 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  38.95 
 
 
425 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.76 
 
 
424 aa  282  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.43 
 
 
436 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.87 
 
 
426 aa  279  8e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.11 
 
 
431 aa  277  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.75 
 
 
438 aa  277  3e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  37.35 
 
 
428 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.52 
 
 
430 aa  276  7e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.66 
 
 
439 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.28 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  38.46 
 
 
429 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  38.26 
 
 
425 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  38.26 
 
 
425 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  35.24 
 
 
423 aa  271  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  37.1 
 
 
428 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  37.35 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  37.35 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  37.35 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  42.82 
 
 
431 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  37.35 
 
 
428 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  37.72 
 
 
425 aa  268  1e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  37.1 
 
 
428 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  37.31 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  42.61 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  37.1 
 
 
428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  37.1 
 
 
428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  36.86 
 
 
428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  37.1 
 
 
428 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.86 
 
 
434 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.36 
 
 
473 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 
439 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.54 
 
 
448 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  37.67 
 
 
446 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  35.47 
 
 
459 aa  261  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.14 
 
 
428 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 
430 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  42.22 
 
 
442 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  35.22 
 
 
425 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 
429 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  36.3 
 
 
430 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  41.98 
 
 
431 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  41.98 
 
 
431 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  41.98 
 
 
431 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.73 
 
 
437 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  40.05 
 
 
439 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  40.99 
 
 
430 aa  256  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  34.65 
 
 
425 aa  256  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  35.39 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  41.44 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  34.86 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.64 
 
 
425 aa  254  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.63 
 
 
426 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  40.3 
 
 
428 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  40 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  40.2 
 
 
430 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.29 
 
 
437 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  35.62 
 
 
440 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 
427 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  39.15 
 
 
451 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.53 
 
 
425 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0502  dihydroorotase  43.16 
 
 
417 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  33.88 
 
 
447 aa  249  7e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  36.81 
 
 
442 aa  249  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.82 
 
 
497 aa  249  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.93 
 
 
425 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>