48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0343 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  96.83 
 
 		 567 aa  1150    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  89.77 
 
 		 567 aa  1070    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  96.47 
 
 		 567 aa  1150    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 567 aa  1177    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  51.73 
 
 		 583 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  54.13 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  51.73 
 
 		 583 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  52.08 
 
 		 583 aa  611  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  53.25 
 
 		 568 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  52.55 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  51.65 
 
 		 578 aa  592  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  52.8 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  52.78 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  49.05 
 
 		 583 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  50.72 
 
 		 569 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  51.84 
 
 		 570 aa  565  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  50.09 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  48.4 
 
 		 582 aa  532  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  46.31 
 
 		 597 aa  529  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.3 
 
 		 584 aa  521  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.89 
 
 		 584 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  45.65 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  44.9 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  42.58 
 
 		 565 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.83 
 
 		 566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.06 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  40.58 
 
 		 555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  40.61 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.71 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.89 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.79 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.3 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.94 
 
 		 561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  40.04 
 
 		 549 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.46 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.96 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  32.87 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.41 
 
 		 548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.56 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.95 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.22 
 
 		 542 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.84 
 
 		 548 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.84 
 
 		 548 aa  309  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.98 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  44.78 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  35.82 
 
 		 988 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  38.1 
 
 		 474 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>