92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1289 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  57.04 
 
 		 583 aa  708    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  57.9 
 
 		 583 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 584 aa  1219    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  56.28 
 
 		 583 aa  701    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  56.16 
 
 		 597 aa  711    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  73.2 
 
 		 584 aa  932    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  57.39 
 
 		 583 aa  710    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.41 
 
 		 567 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  45.06 
 
 		 567 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  44.89 
 
 		 567 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  45.58 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  44.35 
 
 		 566 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.77 
 
 		 570 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  44.46 
 
 		 568 aa  500  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  42.05 
 
 		 570 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  42.49 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.79 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  41.35 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.07 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  41.24 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.82 
 
 		 570 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  41.65 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  41.33 
 
 		 582 aa  465  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  40.91 
 
 		 565 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.3 
 
 		 566 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.83 
 
 		 552 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.63 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  36.28 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.97 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.21 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.66 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.68 
 
 		 561 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35.01 
 
 		 561 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.74 
 
 		 561 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.07 
 
 		 566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  36.1 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  31.26 
 
 		 572 aa  279  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.83 
 
 		 542 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.78 
 
 		 543 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.29 
 
 		 543 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.99 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.14 
 
 		 548 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.15 
 
 		 548 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.15 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.67 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  29.7 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  43.75 
 
 		 414 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  45.31 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  31.91 
 
 		 426 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.46 
 
 		 412 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  39.68 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  42.67 
 
 		 461 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  39.19 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  28.12 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  33.87 
 
 		 423 aa  47.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  44.78 
 
 		 407 aa  47.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.41 
 
 		 488 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.98 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  31.3 
 
 		 423 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  37.97 
 
 		 413 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  28.12 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  23.13 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  29.79 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.1 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  34.92 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  39.68 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  37.68 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  39.68 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  34.72 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.1 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  30.39 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  35.21 
 
 		 1005 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  34.38 
 
 		 424 aa  44.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  29.9 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  41.82 
 
 		 471 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  40 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.7 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  35.62 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.67 
 
 		 434 aa  44.3  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  35.16 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  37.7 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  36.51 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  36.07 
 
 		 481 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  36.51 
 
 		 469 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.21 
 
 		 425 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  34.92 
 
 		 385 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  35.94 
 
 		 379 aa  43.9  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 479 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.06 
 
 		 431 aa  43.9  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 424 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>