More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1303 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  100 
 
 
414 aa  811    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  66.17 
 
 
411 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  66.67 
 
 
411 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  66.42 
 
 
408 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  59.31 
 
 
408 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  59.06 
 
 
410 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  58.81 
 
 
408 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  58.81 
 
 
408 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  57.43 
 
 
418 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  59.06 
 
 
408 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  59.06 
 
 
408 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  59.06 
 
 
408 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  59.06 
 
 
408 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  58.56 
 
 
408 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  62.84 
 
 
404 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  60.4 
 
 
417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  61.75 
 
 
399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  65 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  60.1 
 
 
412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  58.56 
 
 
408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  57.57 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  56.62 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  58.44 
 
 
414 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  58.96 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  60 
 
 
420 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  57.32 
 
 
410 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  62.75 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  65 
 
 
400 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  60.9 
 
 
400 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  60.44 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  61.85 
 
 
405 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  63.95 
 
 
415 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  60.4 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  62.16 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  60.5 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  61.25 
 
 
402 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  59.46 
 
 
407 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  61.9 
 
 
407 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  59.71 
 
 
431 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  57.25 
 
 
405 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  56.58 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  62.89 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  61.18 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  62.63 
 
 
407 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  62.57 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  62.99 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  62.57 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  60 
 
 
401 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  59.4 
 
 
401 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  59.65 
 
 
401 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  64.58 
 
 
423 aa  434  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  60.05 
 
 
431 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  60.5 
 
 
402 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  62.11 
 
 
407 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  59.75 
 
 
401 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  60 
 
 
401 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  57.67 
 
 
406 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  62.11 
 
 
407 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  57.89 
 
 
401 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  62 
 
 
407 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  50.98 
 
 
445 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  56.39 
 
 
405 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  55.22 
 
 
402 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  61.54 
 
 
425 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  57.43 
 
 
406 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  61.82 
 
 
405 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  57.67 
 
 
406 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  57.25 
 
 
405 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  58.91 
 
 
403 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  58 
 
 
401 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  55.16 
 
 
416 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  57.29 
 
 
403 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  59.85 
 
 
404 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  58.75 
 
 
415 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  53.02 
 
 
446 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  58.6 
 
 
401 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  53.15 
 
 
416 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  60.36 
 
 
403 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  57.36 
 
 
406 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  61.27 
 
 
410 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  64.16 
 
 
416 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  61.01 
 
 
395 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  55 
 
 
402 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  52.12 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03129  imidazolonepropionase  50.96 
 
 
419 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  52.37 
 
 
403 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  52.41 
 
 
407 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  51.24 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  50.99 
 
 
407 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  51.24 
 
 
407 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  51.49 
 
 
407 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  51.49 
 
 
420 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  51.41 
 
 
403 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  56.9 
 
 
407 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  53.48 
 
 
402 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>