29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2849 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  98.13 
 
 
1029 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  97.2 
 
 
1029 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  84.58 
 
 
1029 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  98.4 
 
 
187 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  85.51 
 
 
1024 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  85.51 
 
 
1024 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  84.58 
 
 
1024 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  67.61 
 
 
1024 aa  274  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  63.55 
 
 
1010 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  64.95 
 
 
1021 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  60.58 
 
 
1046 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  57.55 
 
 
1018 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  34.29 
 
 
1020 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  38.33 
 
 
1005 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  35.5 
 
 
908 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  32.23 
 
 
1010 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  32 
 
 
988 aa  92.8  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  100 
 
 
839 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  26.84 
 
 
402 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  27.11 
 
 
389 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  41.03 
 
 
405 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  20.63 
 
 
582 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  39.47 
 
 
399 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  39.47 
 
 
399 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  40.3 
 
 
408 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  31.82 
 
 
444 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  34.62 
 
 
1062 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  33.85 
 
 
422 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>