44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1509 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  99.47 
 
 
1029 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  98.4 
 
 
1029 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1509  amidohydrolase  100 
 
 
187 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00999968  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2849  amidohydrolase  98.4 
 
 
234 aa  376  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  83.96 
 
 
1029 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  86.1 
 
 
1024 aa  321  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  86.1 
 
 
1024 aa  321  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  85.03 
 
 
1024 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  61.93 
 
 
1010 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  66.67 
 
 
1024 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  58.56 
 
 
1046 aa  225  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  62.03 
 
 
1021 aa  222  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  56.22 
 
 
1018 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  33.33 
 
 
1020 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  33.53 
 
 
908 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  33.33 
 
 
1005 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.89 
 
 
1010 aa  75.9  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  30.22 
 
 
988 aa  68.6  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  43.59 
 
 
405 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.57 
 
 
402 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  31.78 
 
 
419 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  40.79 
 
 
399 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  40.79 
 
 
399 aa  47.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  35.9 
 
 
1062 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  41.79 
 
 
408 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.38 
 
 
422 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  26.63 
 
 
443 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  38.24 
 
 
390 aa  44.7  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2104  amidohydrolase  21.38 
 
 
582 aa  44.7  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  29.23 
 
 
389 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  51.35 
 
 
411 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  38.98 
 
 
1084 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  22.52 
 
 
387 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  41.67 
 
 
409 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  31.5 
 
 
396 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  46.81 
 
 
1078 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  44.44 
 
 
384 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  40.68 
 
 
1071 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  41.67 
 
 
409 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  41.67 
 
 
409 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  31.06 
 
 
444 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  43.18 
 
 
1111 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  39.62 
 
 
442 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  32.05 
 
 
388 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>