173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4192 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  100 
 
 
405 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  85.57 
 
 
408 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  52.34 
 
 
384 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  51.18 
 
 
387 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  51.32 
 
 
382 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  50.39 
 
 
387 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  51.44 
 
 
399 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  51.44 
 
 
399 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  48.42 
 
 
382 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  48.42 
 
 
382 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  37.24 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  36.72 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  38.2 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  34.92 
 
 
452 aa  236  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  36.6 
 
 
402 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  36.29 
 
 
378 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  37.21 
 
 
380 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  35.25 
 
 
396 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  36.32 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  33.25 
 
 
377 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  32.9 
 
 
378 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  34.64 
 
 
379 aa  196  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  37.76 
 
 
378 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  34.38 
 
 
395 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  34.2 
 
 
381 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  32.98 
 
 
377 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  33.68 
 
 
397 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  34.99 
 
 
388 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  35.11 
 
 
397 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  34.32 
 
 
397 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  31.15 
 
 
378 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  32.45 
 
 
379 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  34.82 
 
 
392 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  31.41 
 
 
378 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  31.15 
 
 
378 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  33.77 
 
 
381 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  31.41 
 
 
378 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  31.15 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  33.51 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  32.02 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  31.15 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  34.2 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  36.46 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  32.91 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  33.85 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  30.89 
 
 
378 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  34.46 
 
 
379 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  31.22 
 
 
410 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  30.89 
 
 
378 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  32.73 
 
 
374 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  34.99 
 
 
384 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  34.73 
 
 
434 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  34.29 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  33.33 
 
 
378 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  34.97 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  33.94 
 
 
379 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  33.16 
 
 
389 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  33.68 
 
 
384 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  32.72 
 
 
388 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  31.59 
 
 
378 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  32.46 
 
 
377 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  35.39 
 
 
391 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  37.5 
 
 
378 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  30.94 
 
 
388 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  30.46 
 
 
410 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  30.66 
 
 
388 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  33.25 
 
 
378 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  32.55 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  32.98 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  34.12 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  32.98 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  35.31 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  31.57 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  31.66 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  31.66 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  34.3 
 
 
380 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  33.07 
 
 
385 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  32.01 
 
 
378 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 
377 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  32.01 
 
 
378 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  34.47 
 
 
384 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  34.72 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  32.21 
 
 
378 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  31.38 
 
 
378 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  37.82 
 
 
589 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  31.82 
 
 
386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.66 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  31.95 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  34.13 
 
 
407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  33.67 
 
 
377 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5867  hypothetical protein  32.34 
 
 
395 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
385 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  43.38 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>