118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4082 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  100 
 
 		 397 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  86.15 
 
 		 397 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  78.84 
 
 		 397 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  69.71 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  64.48 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  51.08 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  51.21 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  48.66 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  48.1 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  40.27 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  36.34 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  36.81 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  35.65 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  35.65 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  35.57 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  35.57 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  33.61 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  32.77 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  36.64 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2917  hypothetical protein  38.62 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3357  alkylphosphonate utilization protein PhnM, putative  37.53 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  32.48 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  34.08 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  34.08 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  35.85 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.32 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  35.91 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  37.05 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  35.83 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  33.33 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  35.38 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  35.28 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  35.42 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  35.73 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  35.73 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  35.73 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  35.73 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  32.98 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  35.73 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  34.02 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  34.26 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  35.47 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  35.46 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  35.1 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  35.1 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  34.07 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  34.48 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  35.18 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  37.19 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  35.81 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  34.72 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  34.9 
 
 		 378 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  34.81 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  36.25 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  34.9 
 
 		 378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  35.52 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  34.48 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  31.77 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  34.08 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  33.89 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  33.6 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  32.83 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  36.42 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  36.42 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  34.35 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  36.5 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  37.27 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  34.08 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  34.81 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  35.93 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  34.62 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  33.33 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  33.15 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  33.61 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  35.8 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  33.88 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  33.06 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  34.96 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  32.14 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  32.14 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  33.79 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  35.62 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  33.88 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  33.33 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  32.78 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  33.43 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  36.24 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  33.42 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  33.42 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  33.42 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  33.42 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  31.04 
 
 		 380 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  33.42 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  33.52 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  33.52 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  35.62 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  34.82 
 
 		 589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  32.97 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  32.62 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  31.41 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>