117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3831 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  95.31 
 
 		 384 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  86.98 
 
 		 384 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  100 
 
 		 384 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  85.42 
 
 		 392 aa  666    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  77.14 
 
 		 385 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  56.84 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  54.09 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  53.81 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  50.4 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  55.38 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  52.11 
 
 		 379 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  49.87 
 
 		 379 aa  355  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  49.87 
 
 		 379 aa  355  5.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  51.45 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  48.96 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  48.16 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  49.07 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  48.28 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  46.72 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  45.41 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  49.61 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  47.12 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  45.9 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  45.66 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  47.55 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  44.96 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  46.21 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  47.55 
 
 		 387 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  44.65 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  47.01 
 
 		 380 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  46.19 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  43.64 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  45.17 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  44.7 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  45.79 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  43.31 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  42.63 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  42.63 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  44.76 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  43.42 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  42.37 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  42.63 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  42.63 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  42.37 
 
 		 378 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  42.37 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  42.11 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  43.57 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  44.92 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  42.78 
 
 		 378 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  42.78 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  43.72 
 
 		 380 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  42.78 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  41.99 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  46.07 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  46.34 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  47.26 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  46.07 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  46.07 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  46.34 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  46.07 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  41.21 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  43.15 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  45.81 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  41.58 
 
 		 378 aa  266  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  40.84 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  40.53 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  40.53 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  41.15 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  37.99 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  38.62 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  36.94 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  36.81 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  37.23 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  37.23 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  37.67 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  37.67 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  37.17 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  32.53 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  33.25 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  33.85 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  33.51 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  33.42 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  34.12 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  33.79 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  33.7 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  37.74 
 
 		 589 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 410 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  33.33 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  33.43 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  32.14 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  35.93 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  33.24 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  35.2 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  30.39 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3357  alkylphosphonate utilization protein PhnM, putative  33.7 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2917  hypothetical protein  33.04 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  30.63 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>