95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3662 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  100 
 
 		 316 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  82.39 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  71.7 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  86.03 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  69.63 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  60.9 
 
 		 384 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  55.88 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  55.88 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  50 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  50 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  50 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  43.38 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  45.59 
 
 		 408 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  41.41 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  41.41 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  32.87 
 
 		 406 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  29.79 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  33.93 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  33.93 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2525  hypothetical protein  36.15 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  31.58 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  34.04 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  32.03 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  29.19 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  29.19 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  33.04 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  29.24 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  30.67 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  31.4 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  31.62 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  35 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  34.51 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  31.62 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  29.91 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  32.71 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  29.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  29.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  29.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  33.33 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  29.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  29.91 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  29.91 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  30.99 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  28.76 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  34.29 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  28.97 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  31.25 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  33.63 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  29.32 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  30.94 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  32.56 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  42.03 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  33.63 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  30.56 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  33.06 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  27.14 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  31.9 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  28.23 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  26.51 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  33.63 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  24.39 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  27.01 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  29.6 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4900  hypothetical protein  40 
 
 		 625 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180307  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  33.91 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  27.36 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  36.36 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  28.57 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  28.24 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  29.94 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  25.98 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  25.56 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  25 
 
 		 379 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  36.92 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  36.92 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  25.32 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  28.47 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  25.2 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  24.18 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  29.91 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  27.54 
 
 		 385 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  27.68 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  22.83 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  23.08 
 
 		 410 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>