101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0468 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2525  hypothetical protein  63.26 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  55.11 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  55.11 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  45.85 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  42.91 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  41.41 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  26.07 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  26.53 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  31.56 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  26.28 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  29.33 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  28.25 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  25.91 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  25.91 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  25.91 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  29.33 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  31.11 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  29.09 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  26.81 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  29.73 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  30.36 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  28.03 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  29.55 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  30.63 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  28.83 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  27.01 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  30.04 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  30.63 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  28.89 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  29.19 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  29.27 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  26.04 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  25.96 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  29.09 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  27.68 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  30.18 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  28.33 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  31.44 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  28.82 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  25.26 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  25.62 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  26.24 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  28.12 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  23.94 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  27.35 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  29.82 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  30.06 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  29.91 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  29.65 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  30.81 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  24.61 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  25.75 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  30.58 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  24.22 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  27.87 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  24.61 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  29.77 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  32.28 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  26.79 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  26.76 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  29.47 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.81 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  27.87 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  25.88 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  28.68 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28.49 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  27.66 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.2 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  23.97 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  27.56 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  24.86 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>