115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1866 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  93.79 
 
 
290 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  94.81 
 
 
290 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  87.93 
 
 
290 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  65.93 
 
 
299 aa  348  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.32 
 
 
293 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  41.75 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  44.36 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  43 
 
 
293 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.25 
 
 
293 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  39.72 
 
 
303 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  40.83 
 
 
287 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  44.57 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.78 
 
 
286 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4360  hypothetical protein  79.49 
 
 
90 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  32.99 
 
 
286 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  32.99 
 
 
286 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  32.99 
 
 
286 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  32.99 
 
 
286 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  32.99 
 
 
277 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  34.11 
 
 
285 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  34.21 
 
 
280 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  34.01 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  31.08 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  33.19 
 
 
280 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  33.91 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  32.43 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  32.43 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  27.72 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  31.63 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  28.06 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  33.62 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  29.45 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  30.95 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  27.92 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  32.07 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  36.68 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  30.61 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  32.54 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  32.53 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  29.43 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  29.21 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  30.1 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  28.82 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  30.58 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  30.24 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  30.58 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  31.58 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  30.6 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  30.17 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  32.43 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  32.43 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  32.43 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  32.43 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  28.27 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  29.55 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  28.3 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  30.22 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  33.19 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  32.31 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  28.88 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  33.19 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  31.4 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.36 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  31.74 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  32.43 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.56 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  31.56 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  30.71 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  32.3 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  32.3 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  30.84 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  29.51 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  30.49 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  27.15 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  27.15 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  29.35 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  34.15 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  28.89 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.48 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  28.51 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  38.94 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>