236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2962 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  99.67 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  99.67 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  89.7 
 
 		 301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  93 
 
 		 300 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  90.67 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  90.67 
 
 		 300 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  79.39 
 
 		 512 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  79.39 
 
 		 343 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  75.25 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  79.39 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  79.32 
 
 		 306 aa  447  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.32 
 
 		 299 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  59.66 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  56.9 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.65 
 
 		 313 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.65 
 
 		 300 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  54.95 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  54.95 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  53.85 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  56.77 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.79 
 
 		 300 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  55.21 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  52.76 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.6 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  54.76 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  54.03 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  55.1 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.4 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  58.01 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  51.57 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  40.47 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  50.74 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  40.47 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  42.47 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  38.85 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  29.02 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  30.71 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  30.71 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.54 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  30.36 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.66 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  30.66 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.76 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.93 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.16 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.68 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.83 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  37.07 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  31.39 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  32.71 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.62 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.14 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.95 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.36 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.73 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.85 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.94 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  28.45 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.96 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  30.22 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.09 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.65 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.44 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.73 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  28.17 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  29.3 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.6 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.95 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.7 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.93 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  30.05 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.18 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.38 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  28.95 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.84 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.23 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.56 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.23 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.38 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.49 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.69 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.69 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  28.19 
 
 		 395 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>