More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1589 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  54.18 
 
 		 307 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  48.28 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  44.63 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  46.31 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  46.31 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  44.52 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  42.45 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  47.52 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  48.05 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.12 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 		 287 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  42.53 
 
 		 346 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.78 
 
 		 288 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  41.3 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.76 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  41.99 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 290 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.81 
 
 		 291 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  46.92 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  43.25 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  39.49 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  35.66 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.71 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  43.1 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.23 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.52 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  29.97 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  31.93 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  30.19 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  31.23 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  30.89 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  29.88 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  30.63 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  26.89 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  27.54 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  30.74 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.02 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  30.74 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  30.74 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  30.74 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.28 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  29.31 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.53 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  27.97 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  25.5 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  24.66 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  26.67 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  26.02 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  26.02 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  28.77 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  25.09 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  26.69 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.97 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  24.66 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  26.02 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  26.02 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  26.73 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.02 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  26.02 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  29.29 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  26.4 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  26.02 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  28.38 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  29.76 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  27.3 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  30.63 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.77 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.74 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.96 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.96 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>