More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1044 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  81.09 
 
 		 312 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.92 
 
 		 311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.16 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  67.79 
 
 		 312 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  59.73 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  59.04 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  61.54 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  62.21 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  61.54 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  61.54 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  60.14 
 
 		 397 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  58.36 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  59.59 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  59.59 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  59.59 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  59.59 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  58.84 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  59.25 
 
 		 356 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  59.25 
 
 		 356 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  48.55 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  47.04 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.2 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  38.63 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  35.97 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.15 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.9 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  26.5 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  31.17 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.04 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.64 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  30.1 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  33.79 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.77 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.51 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  32.32 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  35.23 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25.6 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  30.87 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.56 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.55 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.56 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.56 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  28.12 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  29.53 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.92 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  28.8 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.19 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  29.29 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  29.9 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  29.87 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.94 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  28.31 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.19 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  30.35 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.64 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.42 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  29.72 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.28 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.3 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  27.97 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.53 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.53 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.09 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.45 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.94 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.24 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.19 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  30.66 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.79 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>