271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6325 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 329 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  49.83 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  48.1 
 
 		 299 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  47.33 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.21 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  47.4 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  47.4 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.67 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  47.06 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  47.14 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  46.8 
 
 		 512 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  45.96 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  46.8 
 
 		 343 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  42.77 
 
 		 318 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  48.1 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  43.88 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  46.41 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  47.75 
 
 		 300 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  47.75 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  45.55 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  43.6 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  43.6 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  45.07 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  47.75 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  44.03 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  42.35 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  42.57 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  43.64 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  43.75 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  45.42 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.24 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  41.87 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  43.95 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  46.56 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  32.25 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  34.81 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  36.9 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  34.43 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  35.88 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  34.43 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  36.06 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  34.81 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.09 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.09 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  32.76 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  33.68 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  34.93 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  39.74 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  33.1 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  29.35 
 
 		 287 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.35 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.78 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.74 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.01 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.35 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.32 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.9 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25.1 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  24.13 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.59 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  23.95 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.72 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 278 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.76 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  22.5 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  21.51 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.07 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.4 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  22.26 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.05 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  27.04 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.94 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  25.47 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.97 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.93 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  22.97 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.04 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  26.89 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.42 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.11 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  25.09 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  28.76 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.04 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.43 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>