More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1296 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  72.52 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  55.02 
 
 		 295 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  51.63 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  48.33 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  46.98 
 
 		 302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  43.31 
 
 		 295 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  44.69 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  44.69 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  44.69 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  36.88 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  37.59 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  37.23 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  38.18 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.56 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.71 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.27 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.27 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.27 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.73 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.11 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.96 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.89 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  30.19 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  32.71 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.78 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.69 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  28.89 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  27.59 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  30.07 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  30.24 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.57 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  26.82 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.27 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.52 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.99 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.99 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 329 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  29.78 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.82 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  27.42 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.58 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  31.48 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  29.15 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.13 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  29.43 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.22 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  24.39 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.73 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.2 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  26.76 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  26.91 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.5 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  26.64 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  27.42 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  26.64 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.35 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.27 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  24.82 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  25.66 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  28.45 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.48 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.79 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  25.27 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  25.69 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  28.73 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  27.21 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  25.62 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.32 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.71 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  26.18 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  26.48 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.91 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.92 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>