More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1985 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.71 
 
 
323 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  53.41 
 
 
288 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  45.08 
 
 
297 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 
300 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  44.33 
 
 
294 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.36 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  30.72 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
309 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.7 
 
 
317 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  30.14 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  26.87 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.14 
 
 
397 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  31.1 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.63 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.63 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.63 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.93 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.29 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.29 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.95 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.77 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.42 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.81 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.48 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.52 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.94 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.08 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  27.17 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.75 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  30.26 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.14 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.66 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.25 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  28.7 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.63 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  25.89 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.78 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  27.93 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  24.2 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.59 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.21 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  22.9 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  23.4 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.29 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.56 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25.89 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.63 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.76 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  24.61 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  32.43 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  32.43 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  32.43 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.11 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.18 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  22.88 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  31.98 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  31.98 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  31.98 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  31.98 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.42 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  24.82 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.12 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.63 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.34 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  21.94 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  33.18 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.18 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.46 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.44 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0622  hypothetical protein  35.5 
 
 
203 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>