More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1301 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  542  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  50.69 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 		 323 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  45.74 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  43.99 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.35 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.7 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  31.51 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  36.6 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  35.46 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  36.4 
 
 		 397 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  36.14 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  36.17 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  35.82 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  35.82 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  31.14 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  29.68 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  31.54 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.74 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  30.64 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  33.23 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  35.32 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  33.45 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.17 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.9 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  33.9 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.32 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.93 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.93 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.37 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.93 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  24.12 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.84 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  34.59 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  34.59 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  34.59 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  34.59 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.36 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  30.18 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.91 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.63 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.94 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.46 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.03 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  33.11 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.92 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  32.05 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  26.55 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.12 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.27 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.88 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.24 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  30.54 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.45 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  26.41 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  26.15 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.18 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  28.29 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.18 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.04 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  31.37 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  31.41 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.75 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  21.4 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  24.14 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.79 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.42 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  22.08 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>