More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1502 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  95.89 
 
 
292 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  97.72 
 
 
219 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  72.63 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  75.56 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  74.35 
 
 
298 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  74.35 
 
 
298 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  60 
 
 
305 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
288 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  44.49 
 
 
297 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1509  hypothetical protein  95.65 
 
 
82 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.585476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.36 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.12 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  29.62 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.39 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  26.71 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  27.86 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  27.97 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.81 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.86 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.86 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.73 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.95 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.03 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  30.43 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.99 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.47 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.65 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.22 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.48 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.51 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.06 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.77 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.45 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.3 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.22 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.94 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2396  hypothetical protein  66.67 
 
 
49 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.43 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.97 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.09 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  25.51 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  27.17 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.22 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.92 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.92 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30.92 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.72 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.28 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.27 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  27.03 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.34 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  24.36 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  26.32 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.01 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  28.63 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.35 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  21.99 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  23.91 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  23.76 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.94 
 
 
402 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.58 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.91 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.65 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  23.76 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  23.76 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  29.95 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  28.27 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  25.26 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  26.85 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.74 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.61 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  26.44 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.11 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  23.79 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.69 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>