More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1879 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  96.66 
 
 		 300 aa  571  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.86 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.22 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.87 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.61 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.45 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.53 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  25.52 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.52 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.52 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.95 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.32 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.05 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  25.17 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.84 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  30.74 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.85 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  26.26 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  26.26 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  26.35 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.35 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  25.63 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.91 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  25.54 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.21 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  28.24 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.67 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  28.17 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  25.77 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  27.27 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.91 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  26.51 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  23.02 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  24.5 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  28.77 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  25.21 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  23.49 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  26.2 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  20.98 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  23.81 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  22.34 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  25.2 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  23.36 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25.24 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.62 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  24.81 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  24.81 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  24.91 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.56 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  21.4 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  24.82 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  25.46 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  24.82 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.5 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.59 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  27.73 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  24.88 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  23.91 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  25.79 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.94 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  27 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.24 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.3 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.47 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>