More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1925 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  34.64 
 
 
317 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
309 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.98 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.64 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.82 
 
 
397 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.55 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.04 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.63 
 
 
309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.63 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.63 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.84 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.64 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.42 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.95 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.61 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  24.92 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.27 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.48 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  27.61 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  27.61 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.19 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  30.81 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.4 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.6 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  26.81 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.42 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.11 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.11 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  30.63 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.79 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.87 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  27.3 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  23.41 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  27.31 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  23.53 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  32.28 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.31 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.59 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  24.75 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.33 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  27.06 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  30.84 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  28.02 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.8 
 
 
274 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.2 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.2 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.62 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.37 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.7 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.24 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  29.66 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.7 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.08 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.08 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.63 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  24.44 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.23 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.76 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.47 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.63 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  27.04 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.25 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>