140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0621 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 310 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  32.08 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.66 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  28.17 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  27.91 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  27.3 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  27.33 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.9 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  28.99 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  28.99 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  28.99 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.86 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  28.57 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  32.17 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  33.46 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  30.42 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  30.42 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  28.39 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.16 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  26.18 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.21 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.16 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.16 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  28.3 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.3 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.67 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.73 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.87 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.87 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.87 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  28.78 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  26.35 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  29.39 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  28.11 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  31.37 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  30.18 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  26.09 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.68 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  25.45 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  25.45 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.54 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  25.45 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  25.45 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  26.16 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.83 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  25.93 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  28.38 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  28.21 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.76 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  25.77 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  29.48 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  25.87 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  25.52 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  22.92 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.51 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.05 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.15 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  41.9 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.73 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  31.49 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  25.44 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  30.83 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  29.26 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.09 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.78 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.68 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.26 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  39.6 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  35.92 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  35.92 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  24.59 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  32.78 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  29.91 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.26 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  34.95 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.65 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.55 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>