180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3095 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  47.95 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  42.2 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  38.68 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.01 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.08 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.42 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  30.84 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  29.59 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  26.13 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  25.87 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.52 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  29.08 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  24.24 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  22.34 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  29.08 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  27.02 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.59 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.61 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  30.53 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25.59 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.51 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.27 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.22 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  21.84 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.27 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  23.05 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.84 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.73 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.78 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25.42 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  30.25 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  31.09 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.54 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  30.25 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  29.46 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  29.21 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  24.81 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  21.59 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  23.9 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.78 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.75 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.05 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  26.76 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.58 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  26.15 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  27.15 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.77 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  24.9 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  25.98 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.8 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  25.98 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.22 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  30.23 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  29.69 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  26.53 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.73 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  20.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  24.73 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.62 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  29.2 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.82 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  24.39 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  30.05 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  26.17 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.18 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  21.56 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  31.82 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  25.53 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>