More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1174 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  72.52 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  52.46 
 
 		 295 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  48.26 
 
 		 302 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  48.26 
 
 		 302 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  53.69 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  40.07 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  42.16 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  44.24 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  43.53 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  36.17 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  36.14 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  37 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  35.29 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.74 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.77 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  34.66 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.58 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.58 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.58 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  34.3 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.48 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  30.85 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.6 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.66 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.98 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.03 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.03 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  25.76 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.05 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.1 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.3 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  29.31 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.06 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.1 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  29.06 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  31.62 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.24 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.23 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.98 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.96 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.77 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  28.16 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  25.17 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.92 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.24 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.96 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.03 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  27.59 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.03 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.16 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.03 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.72 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  29.22 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  25.17 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  29.8 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  23.94 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  29.9 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  29.18 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  24.7 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  31.15 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  25.78 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.89 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.71 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  26.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  27.72 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  29.63 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.34 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.08 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  30.99 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.32 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  24.81 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>