More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2239 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  38.36 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  36.82 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  34.15 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  34.95 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  33.45 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  34.86 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  36.75 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.64 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  31.67 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25.82 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.35 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  25.36 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.42 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  24.36 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  25.36 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  26.74 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  24.39 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.63 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.64 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  28.04 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  23.94 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.94 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.93 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  26.45 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.17 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  28.02 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  25.86 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  21.79 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  28.78 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.25 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.94 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  26.03 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  26.53 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.89 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  29.15 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  26.39 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.37 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  26.91 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  25.78 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  26.67 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  25.69 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  27.08 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  24.19 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.06 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  27.63 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.13 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.27 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  23.3 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  21.6 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  25.09 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  26.25 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.75 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  22.81 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  22.97 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  26.09 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  24.52 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25.44 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.14 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  24.71 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25.44 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  25.44 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  23.26 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  24.54 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.47 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.73 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  25.54 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  25.35 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  27.23 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  26.48 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.77 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.73 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  23.53 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  24.07 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  25.51 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.77 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  24.62 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.64 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  25.23 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  26.13 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  22.67 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>