More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2060 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  614  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  97.43 
 
 
311 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  67 
 
 
303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.37 
 
 
307 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  33.82 
 
 
317 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  34.71 
 
 
298 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  33.78 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.29 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  32.36 
 
 
296 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  33.67 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  32.73 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  32.99 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.18 
 
 
317 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.1 
 
 
293 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
305 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.41 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.08 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.93 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  32.19 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  34.06 
 
 
279 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  119  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.21 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  30.53 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.16 
 
 
339 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.7 
 
 
295 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  28.63 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  34.27 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  29.93 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.58 
 
 
298 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  28.33 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  32.17 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  32.76 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.25 
 
 
331 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  30.45 
 
 
309 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  29.49 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.24 
 
 
300 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  30.34 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.37 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  31.2 
 
 
285 aa  109  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.84 
 
 
288 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  29.54 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  27.46 
 
 
284 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.84 
 
 
288 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  30.85 
 
 
297 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.55 
 
 
295 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.9 
 
 
305 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.39 
 
 
314 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.69 
 
 
287 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
325 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27.05 
 
 
305 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.84 
 
 
302 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.09 
 
 
281 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.6 
 
 
310 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.09 
 
 
281 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 
288 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  26.25 
 
 
273 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.69 
 
 
318 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.96 
 
 
277 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.67 
 
 
324 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.09 
 
 
281 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25 
 
 
297 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  32.6 
 
 
317 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.25 
 
 
304 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  34.87 
 
 
294 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.36 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  30.18 
 
 
338 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.21 
 
 
333 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  30.26 
 
 
338 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  30.28 
 
 
295 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
314 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.31 
 
 
320 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.51 
 
 
319 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  31.77 
 
 
310 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  33.09 
 
 
285 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  30.9 
 
 
295 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 
301 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.28 
 
 
307 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  30.9 
 
 
295 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.09 
 
 
302 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  30.07 
 
 
295 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.46 
 
 
311 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.5 
 
 
294 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  29.76 
 
 
299 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.11 
 
 
284 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  33.85 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  30.25 
 
 
307 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.04 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.93 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>