More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1636 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  99.66 
 
 		 295 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  84.75 
 
 		 295 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  51.7 
 
 		 295 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  50.9 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  47.93 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  39.52 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  38.57 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.93 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  33.45 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.69 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.41 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  36.5 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  32.99 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  30.28 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  30.99 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  33.18 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.98 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.14 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.55 
 
 		 347 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.67 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  31.36 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  30.62 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.39 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  30.9 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  33.97 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.78 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  33.95 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  33.95 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.87 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  31.61 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  27.56 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  27.46 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  26.96 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  30.91 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  30.14 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.18 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  31.02 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  27.44 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.58 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.04 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.64 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.81 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  33.49 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  27.82 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  26.59 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.56 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.34 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  34.03 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.65 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.97 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.1 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  28 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  28.88 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.42 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.39 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  24.81 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.94 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.84 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  31.98 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  28.15 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.71 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  25.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.05 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.44 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.83 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  24.82 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27.61 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0664  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  27.43 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  33 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  27.08 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.94 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>