More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1722 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  75.34 
 
 		 291 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  59.86 
 
 		 292 aa  351  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  59.59 
 
 		 301 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  38.32 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  37 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  37.59 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  38.18 
 
 		 302 aa  175  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  35.94 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  36.01 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  38.41 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  37.23 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  36.01 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.63 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  34.18 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  34.67 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.6 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.6 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.6 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.63 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.64 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.72 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  32.42 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  32.42 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  31.64 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  31.64 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  31.05 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.14 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.14 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  30.84 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  29.47 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.15 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.34 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  29.12 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.74 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.11 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.25 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  28.1 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  29.2 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.61 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.48 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.48 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.18 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.6 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  28.36 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  29.97 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.48 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.37 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.35 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  26.96 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.91 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  29.53 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  27.34 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  27.34 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  25.26 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.8 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.83 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  25.09 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.7 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  25.7 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  31.34 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  26.53 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.74 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  25.26 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  26.95 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.93 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27.59 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.26 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  25.71 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  27.76 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  25.5 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  24.29 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  23.7 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  27.99 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  22.38 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  25.65 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  25.35 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25.35 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25.35 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>