More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3481 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3481  permease  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  38.13 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  36.69 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  32.32 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  34.67 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  33.94 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  33.08 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  35.77 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  32.32 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  30.71 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  30.91 
 
 		 302 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  31.94 
 
 		 269 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  32.7 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  30.55 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  32.48 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.87 
 
 		 334 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.64 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.08 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  30.15 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.26 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.26 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.26 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  29.04 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  28.68 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.55 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  30.11 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.11 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.68 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.6 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.62 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  27.18 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.18 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.21 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.21 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.21 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.15 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  28.36 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.12 
 
 		 324 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.31 
 
 		 310 aa  92  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  27.46 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.72 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.25 
 
 		 311 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.37 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  29.52 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.96 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.43 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.86 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.56 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.5 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  28.11 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  26.82 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  28.46 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.51 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  28.46 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.67 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.86 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  27.96 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  26.49 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  28.62 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  28.36 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1172  hypothetical protein  26.94 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  29.79 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  28.25 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  26.85 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  26.01 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  26.84 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  26.34 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  27.84 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.01 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  27.14 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.88 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  29.91 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.51 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  25.84 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  23.67 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  22.16 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>