More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_09391 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  97.02 
 
 
302 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  54.96 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  48.26 
 
 
302 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  51.34 
 
 
304 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  46.98 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  47.33 
 
 
295 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  47.84 
 
 
296 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  47.89 
 
 
296 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  48.2 
 
 
296 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  38.18 
 
 
292 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  38.41 
 
 
301 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  36.73 
 
 
291 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  38.32 
 
 
292 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
277 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.55 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.11 
 
 
281 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.11 
 
 
281 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.11 
 
 
281 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.18 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 
283 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  27.45 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.52 
 
 
291 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.55 
 
 
334 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.34 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.34 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  28.67 
 
 
277 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  24.47 
 
 
284 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.3 
 
 
305 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.9 
 
 
287 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25.68 
 
 
318 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.68 
 
 
318 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 
305 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.99 
 
 
324 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 
291 aa  99  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.33 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  25.87 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  30.04 
 
 
269 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.44 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  23.34 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.22 
 
 
286 aa  93.2  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  25.18 
 
 
324 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.28 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.43 
 
 
310 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  23.86 
 
 
307 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  23.63 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  87  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  26.16 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.95 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  26.16 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  23.55 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  28.9 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25.19 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  25.95 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.44 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  22.74 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  23.79 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  23.18 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  23.93 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  26.13 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  24.33 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  25.76 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  25.56 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.36 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.19 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.19 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  24.31 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.13 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  22.6 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.6 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  28.18 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  23.47 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.6 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  22.18 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.06 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  22.88 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.92 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  25.27 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  22.63 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  23.74 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  22.92 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  21.69 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  22.63 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.51 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  26.05 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  23.55 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  21.13 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  23.9 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  22.81 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>