More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2163 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  85.08 
 
 		 295 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  84.75 
 
 		 295 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  52.72 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  52.69 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  46.92 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  40.07 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  40.43 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  39.79 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  34.15 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.21 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  38.06 
 
 		 274 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.71 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  37.44 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.7 
 
 		 334 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  32.02 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  32.37 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.04 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.41 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  31.88 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  30.28 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  32.18 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.2 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  27.56 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  30.31 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.62 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.37 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  33.93 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  32.34 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  28.31 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  33.18 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.47 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.94 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.66 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  32.31 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.64 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  31.16 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  27.2 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  26.94 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  27.48 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.21 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.55 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  28.99 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  29.32 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  28.22 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.3 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.68 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.96 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  28.9 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.67 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  27.51 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  24.39 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  28.64 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.4 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.03 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.91 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.93 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  26.78 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.98 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  27.11 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  29.46 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  23.9 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.57 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.95 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  26.9 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.47 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.37 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  23.21 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  26.45 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.05 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.57 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  27.57 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.56 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.03 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.96 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  26.54 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  24.65 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0664  hypothetical protein  28.82 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  23.56 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  23.56 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>