More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0441 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  55.67 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  54.09 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  54.09 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.95 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  48.63 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  53.77 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  36 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.6 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  36.88 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  34.16 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.17 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  35.51 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.51 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  34.92 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  37.63 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  37.46 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  33.45 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  33.57 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  33.44 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.64 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  33.45 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  34.01 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  35.74 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  35.86 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  35.12 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  35.66 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  32 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  32.85 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  33.11 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  33.1 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  32.76 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.52 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  33.69 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  30.93 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  30.93 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.11 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.68 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  34.27 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  33.1 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  32.75 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  28.62 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  30.28 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  33.1 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  29.96 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.22 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  33.11 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.26 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.39 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  36.59 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  32.52 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  32.08 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.01 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  35.62 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  30.24 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.71 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  34.18 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.12 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.6 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  31.25 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.52 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  33.45 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  33.8 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  32.62 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  31.6 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.11 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.38 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.11 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.51 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  30.6 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  28.01 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  33.85 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.04 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  32.98 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  34.45 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>