More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2777 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  47.35 
 
 		 289 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  46.32 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  46.59 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.84 
 
 		 292 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.49 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  46.24 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  46.24 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  46.13 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  46.89 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  41.91 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  40.71 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.5 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  36.21 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  39.07 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  35.89 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  36.31 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  37.91 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  35.35 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  35.71 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  38.24 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  36.33 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  36.7 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  35.61 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  35.17 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  35.17 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  35.05 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  38.33 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.28 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  34.53 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  35.59 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  34.48 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  32.98 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  36.52 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.71 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  35.19 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  36.2 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  33.56 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  36.82 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.18 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  38.24 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  31.65 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.34 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  32.12 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  37.86 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  32.97 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  32.21 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.9 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  32.41 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  32.38 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  33.92 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.42 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.07 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  30.5 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.4 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.47 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.74 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3066  membrane protein  42.68 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.69 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.08 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.97 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.82 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  31.39 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.68 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.19 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  32.88 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.34 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  29.02 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  31.96 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.99 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.15 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  31.85 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.52 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.85 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  29.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.91 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.22 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.56 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  33.45 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>