More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1260 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89.63 
 
 		 299 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  36.97 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.77 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.37 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.1 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.68 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.41 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  37.14 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  32.73 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.1 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.33 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  36.65 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.59 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  33.45 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.45 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  33.68 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.52 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  35.92 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  35.56 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  31.06 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.59 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  33.69 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.56 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.1 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.69 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.27 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.04 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.92 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.15 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.69 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  30.53 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  33.45 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.16 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.97 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  30.9 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.18 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  29 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.73 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  29 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.03 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.29 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.27 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.22 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.02 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  32.52 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.37 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  29.28 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.03 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.91 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  29.58 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  27.07 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.11 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  25.91 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  24.14 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  30.04 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.27 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.43 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.04 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.14 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  31.43 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.72 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.38 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.39 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  25.81 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  29.3 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  28.12 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.52 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>