More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0156 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  72.91 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  73.09 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  72.33 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  59.39 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  46.74 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  45.14 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  45.09 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  35.07 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  28.9 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.72 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.9 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.58 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.16 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  32.07 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  33.22 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.52 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.77 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  35.64 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  33.11 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.3 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.44 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.8 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  33.1 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.8 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.71 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.39 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  33.22 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  30.56 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.75 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.77 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  30.56 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.62 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.92 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  29.69 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  32.88 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.47 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  27.91 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.3 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.58 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.45 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.62 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  34.07 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.91 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.97 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.51 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.53 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.92 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.87 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.68 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  32.08 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.41 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.51 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  29.96 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.45 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  32.2 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.82 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  26.71 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.09 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  29.7 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  31.6 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.86 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  32.27 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.38 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  30.53 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.8 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.95 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.77 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.71 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33.68 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.9 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.9 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  29.55 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.67 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.28 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  31.23 
 
 		 327 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>