More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0238 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  91.5 
 
 		 318 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  91.18 
 
 		 318 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  66.56 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  65.06 
 
 		 313 aa  345  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  57.86 
 
 		 313 aa  325  7e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.27 
 
 		 312 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  53.33 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  56.82 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  53.77 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.12 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  52.15 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  49.84 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  49.67 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  46.67 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  47.3 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.81 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.74 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  40.56 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  37.26 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.87 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  37.55 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  29.33 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.46 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.6 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  32.63 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.74 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  30.48 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.06 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  31.49 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  32.29 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.82 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  34.24 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  30.87 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.84 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.6 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  31.14 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.92 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.14 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.6 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.43 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  32.41 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  30.64 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  31.65 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.72 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.51 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  30.1 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.19 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.19 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.19 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  29.03 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.42 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.69 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  35.74 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  35.33 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.55 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.9 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  36.75 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.11 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.43 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.67 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.99 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.38 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.47 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.6 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.27 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.92 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  32.9 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.97 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  34.67 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.41 
 
 		 269 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.53 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.82 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.1 
 
 		 294 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  30.66 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  29.59 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.18 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.52 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.07 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.72 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.72 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  31.79 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.9 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>