More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09201 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 		 296 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  87.5 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  94.59 
 
 		 296 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  74.23 
 
 		 295 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  48.04 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  48.2 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  42.16 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  47.84 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  44.69 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  44.75 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  36.9 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  35.79 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  36.01 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  37.55 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.16 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  32.32 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  31.39 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.32 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  30.97 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.46 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.46 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.46 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.86 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.73 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  31.23 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  30.83 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.74 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  27.6 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.87 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.87 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  30.2 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.78 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.76 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  30.92 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.28 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.39 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  27.13 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.92 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  24.91 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.44 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  26.03 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  27.2 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  29.86 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.48 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.57 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  27.09 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.34 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  27.65 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  25.85 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.04 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.94 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  25.85 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  23.69 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.2 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.04 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  25.65 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.57 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.24 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  24.65 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.82 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  27.05 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  24.82 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.57 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  20.93 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.27 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  24.44 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  24.89 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  25.09 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  24.92 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  26.13 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  27.18 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  23.49 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  26.74 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  25.47 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  23.3 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  27.18 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  20.96 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  26.13 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  26.37 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>