More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0859 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 		 296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  87.5 
 
 		 296 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  87.84 
 
 		 296 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  73.7 
 
 		 295 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  49.82 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  44.24 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  48.24 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  47.89 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  43.73 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  48.36 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  35.56 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  35.09 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  35.94 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  36.43 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  33.08 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  31.75 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  31.6 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.32 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.68 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.88 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.88 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.88 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.64 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.69 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.69 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  32.81 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  32.41 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.56 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  26.52 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  29.39 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.91 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  25.42 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  27.48 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.57 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  30.53 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.86 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.36 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.62 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.62 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.53 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.68 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.15 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.87 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  24.32 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  24.52 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.3 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  25.94 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  24.46 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  24.04 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  27.08 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  26.77 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  30.22 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  23.81 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.88 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  26.69 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  23.81 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.19 
 
 		 338 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  25.58 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  26.22 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.28 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.35 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.13 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  24.24 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.1 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.49 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.28 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  24.11 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.2 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  24.54 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  27.44 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  27.01 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.41 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.64 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  25.64 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  27.09 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.04 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  24.38 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  25.28 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  20.97 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  24.38 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  24.11 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  24.38 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>