More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2596 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  47.6 
 
 
327 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.26 
 
 
333 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  40.39 
 
 
318 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  40.07 
 
 
318 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  40.07 
 
 
324 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  38.97 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  38.82 
 
 
309 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  38.13 
 
 
334 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  38.71 
 
 
313 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  39.13 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  37.93 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
312 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  36.52 
 
 
300 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 
312 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  39.33 
 
 
338 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  39.33 
 
 
338 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  36.77 
 
 
313 aa  175  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  38.08 
 
 
313 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.79 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  35.4 
 
 
314 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  35.23 
 
 
333 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  31.08 
 
 
297 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.1 
 
 
331 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  29.25 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.74 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  30.74 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  30.57 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  31.94 
 
 
295 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.18 
 
 
311 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.91 
 
 
317 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  29.18 
 
 
311 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.69 
 
 
319 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
307 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.59 
 
 
315 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  26.67 
 
 
302 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  31.06 
 
 
295 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  28.52 
 
 
299 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.47 
 
 
339 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
305 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  26.09 
 
 
291 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.67 
 
 
301 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  32.06 
 
 
302 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
305 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33.61 
 
 
347 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 
333 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.31 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  30.8 
 
 
296 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.75 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  27.82 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.49 
 
 
289 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  30.15 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.76 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.55 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.53 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.19 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.17 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.95 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  26.76 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  28.15 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  26.76 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.69 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  26.76 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  30.17 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
316 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.6 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
291 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.22 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.83 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.32 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.64 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.87 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  33.33 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 
318 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  24.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.85 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  24.33 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.14 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  26.16 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.51 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  27.56 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.94 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  26.94 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25.84 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.01 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.72 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.72 
 
 
279 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25.84 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>