More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3092 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  557  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  59.11 
 
 
298 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  38.44 
 
 
334 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  37.55 
 
 
324 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  37.93 
 
 
318 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  37.93 
 
 
318 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  36.02 
 
 
317 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 
312 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  38.78 
 
 
327 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  35.63 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
312 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  31.7 
 
 
312 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  40.96 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.78 
 
 
333 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  36.64 
 
 
313 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
305 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  33.84 
 
 
338 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  33.08 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  38.08 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  32.96 
 
 
319 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  35.32 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  38.75 
 
 
313 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.88 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  30.04 
 
 
294 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  33.71 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  28.97 
 
 
299 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  34.34 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.53 
 
 
331 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  28.19 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29.21 
 
 
301 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.08 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  23.41 
 
 
302 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  33.95 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  31.05 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.9 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  32.44 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  30.69 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.9 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.9 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.05 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  34.31 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  24.81 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  32.42 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  24.25 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.6 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.13 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.19 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.08 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  23.18 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.85 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.37 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  29.11 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  29.01 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.81 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  31.08 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  30.87 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  27.82 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.56 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  30.14 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.66 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  33 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.24 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.32 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.55 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  29.79 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.35 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.67 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  26.71 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.69 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  29.43 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.28 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  34.87 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.99 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  31.32 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.45 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.27 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.04 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.49 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.67 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  31.82 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.31 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.57 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  30.54 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  30.81 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  28.78 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  31.73 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>